最近，我們碰到一個棘手的技術問題。其他同仁反映，我們開發的變異分析工具在執行 GATK 時意外中止，並呈現以下錯誤訊息：
1 | The provided VCF file is malformed at approximately line number 1: Duplicate allele added to VariantContext: TA |
我檢查該步驟使用的 VCF 檔，發現其中一列的 REF 與 ALT 欄位內容重複，導致 GATK 報錯：
1 | chr1 100 . TA GT,TA |
標準的 VCF 檔只記錄實際存在的變異，不應出現 REF 和 ALT 欄位相同的狀況。即使該位置沒有變異，通常也會以點號（.）標記。因此，我推測問題的源頭不是分析工具本身，而是上游的 variant caller。
為了再次見到又夏，陳晞費時多年打造了一台時光機。然而重逢後，陳晞發現又夏喪失了與她相處的所有回憶。儘管想重新追求對方，身患重病的陳晞深知自己來日無多。因此，陳晞決定全力阻止迫在眉睫的「諸神黃昏」，只為留給又夏一個安穩的未來。於此同時，單戀陳晞的浩瑜也隨她回到過去，竭力尋找能拯救世界又可以挽救陳晞性命的方法。
在孤兒院長大的又夏擁有操控時空的能力。為了保護心儀對象陳晞免遭不幸，同時確保孤兒院院生的安全，又夏穿越不同的時空，試圖阻止悲劇發生。在這段過程中，她反覆經歷與陳晞的相處與離別，累積了深厚的感情。
在修改程式碼之後，開發人員會執行測試以確保軟體的各項功能運行無誤。由於測試通常以程式碼實現，所以它們也可能存在 bug。鑒於這種風險，有些人可能考慮撰寫測試的測試，試圖為軟體的品質把關。
不過，依據這個想法，測試的測試也應該被檢驗其正確性，因此需要額外的測試來支持既有的測試。以此類推，它們會衍生出無窮個測試，形成軟體測試的無限後退難題（infinite regress）。
在實務上，無窮測試顯然不可行，那麼開發人員應該如何確保測試的可信度與有效性呢？
這本書介紹了美學的定義，以及其與日常生活的關係。作者澄清，美學探討人們的美感體驗，而不是引發這些經驗的事物。因此，研究美學的價值在於提升我們的美感體驗。此外，他主張審美是運用注意力的獨特方式，而且深受個人經驗與文化背景影響。因此，在面對審美分歧或欣賞多元藝術時，要抱持「美學謙遜」的態度，了解彼此理解的侷限並努力化解個人與作品間的隔閡。
小鳩與小佐內分手後，各自接受陌生同學的告白，展開新的校園生活。小佐內的交往對象是校刊社的新生瓜野，他認為校刊社的作風保守，所以提議在校刊報導校外題材。瓜野盯上了暑假發生的綁架事件，想藉此展現自己的能力，也期望小佐內能對其刮目相看。然而，因為顧慮小佐內，社長堂島起初拒絕了瓜野的提議。不過在小佐內穿針引線下，一名不起眼的社員以公益為由說服堂島，在校刊開設編輯專欄讓社員自由發揮。
草莓塔事件的一年後，小鳩和小佐內仍然維持著他們理想中小市民應有的生活，一人壓抑著揭穿祕密的嗜好，一人克制追求復仇的欲望，約束彼此多管閒事和挾怨報復的衝動。小鳩一直認為他與小佐內只是互利共生的關係，因此私底下不會有過多的互動。然而，這個夏天，小佐內反常地頻頻邀約，讓小鳩對於她的動機困惑不已。
給定兩條以 FASTA 格式儲存的蛋白質字串，計算兩者互相轉換所需的最少編輯次數。編輯方式包含置換、刪除與插入。
Given: Two protein strings s and t in FASTA format (each of length at most 1000 aa).
Return: The edit distance d(s,t).
學習寫作的一個有效方法是透過閱讀優秀作品，並細心記錄值得借鑒的用字與段落，進而運用在自己的作品中。市面上已經有場景辭典或詞彙工具書幫我們分類詞條，但是自建語料庫能按照習慣規劃，更符合個人需求。
然而，無論是使用現成的還是自建的語料庫，查閱過程往往會打斷寫作節奏，降低其實用性。那麼，要如何管理這些精心收集的語料，才能及時更新又方便取用呢？這篇文章將介紹如何使用 VSCode snippets 的提示與管理功能，將語料庫的應用整合到 markdown 文檔的寫作流程中。
熱愛大海的異鄉少女八代，因為食物短缺而與家人各奔東西，不得不滯留在一個熱愛大地的部落。因為她與部落文化格格不入，所以只能自食其力。一日，部落的長老召喚八代，希望她能前往神之岩向神明求援，幫助他們對抗來自東方部族的威脅。神之岩位於部落外圍的海洋深處，據傳是部落守護神的住所。據目擊者描述，神之岩會發射光束摧毀任何靠近它的物體，所以八代深知此行必死無疑。然而，如果她拒絕這項命令，同樣會遭到其他敵視她的部族成員放逐。